由上可知，如是如来藏妙觉明体一向是寂而常照，灵明觉了的，是故妙觉湛然遍周法界，含吐十虚无有方所。然而，此妙觉明体之六尘以外的灵觉性，与七转识心见闻觉知之妄觉性，却是迥然不同的，以其远离三界六尘故，以其不会五阴、六入、十二处及十八界、一切法之法相故。此心之了知性，是六尘以外之了知性，与了了常知之有念灵知心或一念不生之明觉心、灵知心、寂照心之了知性完全不同。故 佛为免众生堕于一念不生之离念灵知心，妄执定境法尘之意识境界为真心，于《楞严经》开宗明义作此开示：
《楞严经卷一》 佛云：“纵灭一切见闻觉知，内守幽闲，犹为法尘分别影事。”而法莲师所引的这一段经文，是出自《楞严经卷十》，这是 佛从卷一说开悟明心的慧学之理，一直到卷十说完楞严大定的事修次第后，为免众生以定为禅，为免众生落入澄澄湛湛的定境法尘，为免众生错执“一念不生却又能觉能观的离念灵知心就是真心”，再次谆谆教诲，作此总结。此中何者譬为真精？何者譬为颠倒精微细想心？何者譬为精明湛不摇处？法莲师由于如前所说之文字障而堕于文字表相，而起不如理作意之妄想，故完全误解佛意。
当知这里所说的精明湛不摇处， 佛说是“汝等众生妄执的精明湛不摇处，而自认为是恒常之心”，其实不是真精明湛不摇处，非是真常。众生所妄执的这个心就是清清楚楚、明明白白、了了常知的意识心。此心不论住于定外、定中，皆是意识心；设能住于非想非非想定中，犹是意识，非真实心。此心不离前五识，或与其一并起，或与其二并起，乃至或与其五并起，多少不定，然必不能离于五识而单独起，亦不能离于五根而起。唯有在梦中及二禅以上之根本定中，方能离前五识而单独现起。此心虽然能以修定之法修至一念不生，然此一念不生时之灵明觉了、了了常知的意识心，仍是见闻觉知之七转识心，故 佛说此心“于身不出见闻觉知”，非是真精妙明，故云“此湛非真”。法莲师对此经文中之 佛意不能如实理解，作此诽谤如来藏妙法之破法行为，殊堪浩叹！因为 佛说阿赖耶识就是如来藏故，所举楞严中之佛语是说想阴行阴之境界相故，不是在说阿赖耶识之境界相故。
由于同生基——行阴——之无明业行念念迁流不断，看似相续，实则刹那刹那念念生灭不住。由是之故，令意识心依于业习而取违顺之境，成就贪、瞋、痴等身、口、意、行阴，造诸善业、恶业或无记业，故而念念受熏，成就七转识净染法种。如是念念受熏的业引之流， 佛说是“流急不见，非是无流”。是故，犹如水面看似“精湛不摇、不见流急”的灵明觉了、了了常知之意识心，与“非是无流”之同生基——行阴，因七转识无明业行迁流不断，故成净染法种受熏之原由。如是之心同摄于名色之“名”中，同摄于五蕴之“识蕴”中，是虚妄熏习之心，不是能生“名”之阿赖耶识，因为识蕴摄在名中故，所生之识蕴不应含摄能生识蕴之阿赖耶识故，否则即有“识蕴出生识蕴”之严重过失故。但是法莲师对此竟然全无所知，不知警觉，故造下严重破法的大恶业；谤方广正法之人，则成严重破戒之人，显然已经失去出家戒与菩萨戒之戒体，以前所修证之果位，纵使具足三贤十地之果报，也将永远失去，必堕地狱。因为妄谤正法而误以为是护法的人，已经成为地狱种性，已经失去所有戒体，所以本质已经不是出家僧宝之身了，只是身穿僧衣的俗人、凡夫。
此一念不生之离念灵知心，其实也是念念生灭的，只是众生妄习所熏而从阿赖耶识心体中出生的妄想心，皆不离意识之依他起性及末那识之遍计执性，因而出生种种颠倒妄想，故 佛说此心是“第五颠倒细微精想”，识阴所摄。既然 佛已说此颠倒精微细想是识阴所摄，而识阴是由阿赖耶识所生所摄，如果像法莲师所说“阿赖耶识亦是识阴所摄”，则将变成“识阴能出生识阴”，请问法莲师：“识阴如何可能会出生识阴？”果真识阴能出生识阴， 佛应该改口说：“识阴不是由阿赖耶识出生，不是由色阴五根配合阿赖耶识而出生。”则四阿含一切经典皆应改写， 世尊也应该重新再来人间重说四阿含，这就意谓著两千五百年的 释迦世尊还没有成佛，所以说错佛法了；这样就成为谤 佛之大恶业。请问法莲师：“识阴能出生识阴吗？能出生识阴的阿赖耶识可以归类在识阴中吗？”
由此可知，楞严所说水面精湛不摇，水中急流涌现等理，都是指明众生妄想所见，不知本是水之实性之一，不知唯见全水方是真精。是故，说精湛不摇，说急流涌现，都是循业所见，但有名言而无实义。唯于所谓的精湛不摇处，所谓的急流涌现处，如实而见水之实性而不为动静之相所惑，如是全水之性方是真精如来藏，以其函盖湛性、流性、坚性、软性、濡性等全水之性，如实而显其性故。如今法莲师等人虽然引用经文，安立“真精”一名，却于实义无所了知，而堕名言虚妄想之所执者如法莲师等，仍是不离意识之依他起性及末那识之遍计执性，由其堕于名言所执而起颠倒妄想，远离实义之故。
由法莲师书中所言，可以看见一个事实：法莲师先是将阿赖耶识所含藏之念念生灭的七转识种子，颠倒说成是阿赖耶识自体念念生灭；如是混为一谈，故栽诬 佛“曾于《楞严经》中说阿赖耶识是识蕴”。法莲师完全不解 佛说“此五阴元重叠生起，生因识有，灭从色除。”之正理，不能理解经文中所说之意：“五阴都是因阿赖耶识而有，想要灭却五阴而得解脱，却须先从色法的执著上开始灭除”的道理。故法莲师虽因恩师 平实居士之助而悟得阿赖耶识，却因不是正科班出身，未经过禅净班之正修、建立正知见；事后又未曾深入观行，未曾发起深妙般若智慧；最后再因恶知识之误导而产生不如理作意之虚妄想，因此而退转于阿赖耶识本来无生之忍，今已不得大乘无生忍。如是真妄不明、理事不分，妄自否定根本正法的阿赖耶、异熟、无垢识心体，走入邪见之中，云何能遵照 佛所说的“乘悟并销”的正理而见正道？更遑论“因次第尽”的正修行过程了。（p214~237）
