唯物论与唯心论所作的观察与推论都有一定的道理，但也各有偏颇之处。
唯物论认为事物都是由各种因素在一定条件下组成的，都处于运动中，也都会坏灭，这类似佛教的缘起论。因为无明，唯物论者观察不到不生灭的“心”（第八识）在作用，只能观察到有生灭的“心”（识蕴的六识）的存在。识蕴的六识心，须以六根、六尘相触为缘，由藏识流注六识种子，六识心才能现起；若身体毁坏，无根、尘相触，藏识便不流注六识种子，即无六识现象。由于唯物论者只能观察有生灭的“心”的一些生灭现象——如当人的大脑被麻醉后，就没有意识的存在了，于是就得出了一切唯物的结论，这是相当片面的。并且唯物论面对一些先天因素——“秉性”、“天赋”的时候，也无法作出合理的解释。譬如俗语说“龙生龙凤生凤，老鼠天生会打洞”，为什么不用学习，老鼠天生就会挖洞？孩子生下来就会啼哭、吃奶？唯物论认为是基因携带了遗传信息所致。然遗传基因是由脱氧核糖核酸(DNA)在染色体上作特定的线状排列所决定的，DNA仅仅是一种物质（大分子聚合物），如何会具有逻辑思维性，无需其他原因就能自行排列成携带遗传信息的基因？DNA经过特定的排列组合，如何就会让人（动物）具有灵性？若一切先天因素都是遗传基因发生作用的结果，那么一母所生的双胞胎，基因大致相同，后天生活环境也相同，为何有的个性、智商会相差很大？可知，先天因素绝非是由物质（基因）决定的，先天因素，以及DNA的排列顺序必然是由能储存信息且能作用于物质的“心”（藏识）所决定的，唯有“心”才有智慧，才有“逻辑思维性”。此“心”（藏识）必然在胎儿阶段就能作用于受精卵，使得受精卵能按照“心”的“意愿”去生长，若离开“心”的作用，受精卵仅仅是一团肉（物质），没有知觉，没有灵性，绝无法自行长成人类的模样。再者，若人身仅仅是物质的积聚，那么只要持续地增加营养，身体就应该能不停地长高长大，事实显然不是这样的。是以遗传现象的背后，必然是具有灵性的“心”（藏识）在控制着这一切，唯物论无法发现此“心”（藏识）的存在，所看到只是表面现象而已。唯物论者认为“人死如灯灭”，不信轮回，不信因果报应，这种人生理念若不加以正确引导，有演化成极端利己主义的可能。今人大多信仰唯物论，过于迷信科学。科学乃三界有为法，只能研究物质世界的一些现象，无法切入“心灵”层面，是以许多科学家——如居里夫人、爱迪生、牛顿等仍有宗教信仰，且不论他们所信仰的宗教正确与否。科学发展于造福人类的同时，应朝向揭示真理以提升人类道德品质方面努力，依靠人类自身的善行所得的福报来改善现状，若将科技用于竞争劫夺，必将导致人类的自我毁灭。
唯心论者观察到物质（肉体）没有灵性，没有思想，认为“精神”（心）可以独立存在，观察的方向虽然正确，但是因为无明，他们和唯物论者一样，也不知道自心藏识的存在，故其所认为的“精神”——“理念世界”、“灵魂”、“意识”等，有的是臆想，有的是因缘所生法，都不能独自存在，更无法决定物质。
因此，无论唯心论，还是唯物论在解释物质与精神的关系时，都落于偏颇，唯有佛教所说的“三界唯心”，才能正确全面地揭示出物质与精神的本质。
虽然从哲学的角度来划分，可以将佛教所说的“三界唯心”划归唯心一元论（一元论是指主张世界的本原只有一个的哲学学说），但是佛教的“三界唯心”所说的“心”，并非唯心主义所说的“理念世界”、“灵魂”、“意识”、“精神”等，而是唯心主义所不知的本心第八识阿赖耶识（异熟识）。此“心”若经参禅开悟即可实证、体验，而非学术上的假想与推理。故佛法所说之“三界唯心”迥异于唯心主义的观点。
还有学人不明白佛说之“心能造物”的原理，遂将佛说之能生万法之藏识与一神教所说之第一因的造物主（上帝、梵）等同起来，其实二者的本质是完全不同的。譬如，佛教实证在无始劫以来，轮回之众生以及其所生活的宇宙器世间就存在，并非先有藏识，之后藏识再造出有情及器世间；一神教则认为先有造物主，而后造物主创造了一切。藏识与所造之众生非一非异，和合运作，藏识也能被其所造之众生的身口意行所熏；而造物主则是完全凌驾于所造物之上的。器世间是共业有情各自的藏识共同造就的，一神教则认为器世间是造物主一人所造的。藏识是无我性的，没有好恶，随缘应物而不作主，藏识所造器世间及有情色身之优劣所依据的是藏识内业种的染净程度；上帝是有我性的，上帝造物不是依据个人喜好，就是随心所欲……故不能把三界唯心等同于外道的第一因论。
