世尊说完了流转门与还灭门的道理之后，告诉婆罗门，你问佛世尊说的是什么法？现在为你开示：我说因、论因，说因缘世间成的流转门，与因缘世间灭的还灭门。到这里，我们可以确认了 世尊所说完整的法义，它必须要具有流转门与还灭门的两边；如果不能知彼法如何流转，则不能知彼法如何还灭。
现在一般人讲到解脱道，通常都只用心于还灭门，但那只是后半部；因为不知道前半部流转门，不知道流转之因，也不知道流转的次第顺序，不明流转则还灭不能成，所以无论怎么样的努力苦行，都没有办法进入还灭门的正行。例如，在遍地假名善知识的误导之下，现在的学佛人常常以为人只有六个识----眼、耳、鼻、舌、身、意识----以为把六个识消灭，或者是好好地管带住，让六识不起妄念，就说是见道了、是成就了。然而，世尊在前面的经文中告诉我们，先有本识出生六根与六尘，根、尘相触才会有六识的出生；六识心，祂只是六根与六尘后来出生的产品罢了，不论六识存在与否，先前的六根与六尘是早于六识而现存的。
在现在很多的禅七活动当中，那一些瞎眼阿师把禅七修行的目的说为“打得念头死，许尔法身活”；但是即使念头都没有了，吾人仍然在轮回之中，一分也不少，只是从这一边轮回改成那一边轮回，仍然继续在轮回。这一种将意识界视为本识法界的想法，本身就已经是大大的错误了，这不是世尊的教法，乃是一盲引众盲，相将入火坑啊！这就是不明白流转门的道理，就没有办法真正进入还灭门；不知流转则不知还灭，不仅二乘的解脱道是如此，大乘的佛菩提道更是如此。例如，大乘菩萨所现观的百法明门，即是双具观行原本无明之下百法的流转门，转依于如来藏的清净无生，进而能一一灭除彼法的还灭门。
我们来看一则公案：马祖道一禅师年轻的时候，在衡岳山参究，每天常常在大殿上打坐精进。住持和尚南岳怀让禅师知道马祖是接法的道器，于是就上前问说：“年轻人！你每天坐在这里干什么呢？”马祖道一正在静坐，随口回答：“打坐。”“那么你打坐图的是什么呢？”“图的是成佛！”接下来，怀让禅师就在庙前拿了一块砖头磨呀！磨呀！马祖忍不住问：“请问禅师，你磨砖头干什么？”“为了要做镜子呀！”“你磨砖头怎么能做镜子呢？”怀让禅师就反问：“那么你打坐怎么能成佛呢？”马祖知道有蹊跷，于是就问：“那请问禅师，如何才是？”怀让禅师又反问：“假如驾车时，牛车不前进，是该打牛呢？还是该打车？”至此，马祖不敢再说话。怀让继续说：“你坐禅是为了要成佛，然而禅不是坐与卧，佛也没有定相；于此无住之法，不在取舍之中。如果你说禅坐是为了要成佛，那就是杀佛了；执意要在禅坐中成佛，这不是佛法的道理。”当时的马祖似懂非懂，又问说：“那么本识之心有成或坏吗？”怀让回答：“若以成、坏、聚、散来成佛道的话，这连见道都不是了。”
“牛车”是指我们的蕴处界身，而“牛”指的是能出生蕴处界的本识。车子不前进了，问题是在于拉车的牛，否则无论我们怎么打车子，问题还是得不到解决。所以说，轮回的主体不是六识，也不是六根与六尘，而是 佛所说的唯一因----入胎识。
例如，佛在《阿含经》中说：
【云何色集，受、想、行、识集？缘眼及色眼识生，三事和合生触，缘触生受，缘受生爱，乃至纯大苦聚生，是名色集。如是，缘耳、鼻、舌、身、意，缘意及法生意识，三事和合生触，缘触生受，缘受生爱。如是乃至纯大苦聚生，是名色集，受、想、行、识集。】（《杂阿含经》卷3）
好！在这里，佛说什么叫作五蕴的蕴集、色法的蕴集、受想行识的蕴集呢？比方说，因为有了眼根与色法，眼识才会出生，根、尘、识三者和合所以有了触，有了触就会有受，有受就会有爱，然后就这样子辗转的各种大苦的蕴集就出生了，这是名与色的蕴集。也就像这样子，缘于耳鼻舌身而生识，缘于意根与法尘而生意识，然后生大苦蕴集，这就是名色之集，是受、想、行、识的蕴集，就是苦的蕴集呀！
在《杂阿含经》里面 世尊说到：
【“何法有故名色有？何法缘故名色有？”即正思惟，如实、无间等生：识有故名色有，识缘故有名色有。我作是思惟时，齐识而还，不能过彼。】（《杂阿含经》卷12）
在这一段经文，世尊回忆起祂自己过去世的观行，在那一世呢，祂得到了古仙人道。世尊说：五蕴名色之法从何而来？缘于哪一个法才会有五蕴名色呢？世尊当时作正思惟，正理如实、无间出生：因为有本识，所以名色有；缘于本识，所以名色就会出生。世尊当时作这个观行的时候，确立了万法的根源就是这个本识，一切的万法推究其根源，都是这个出生万法的第一因本识；再也没有一个法能够超过本识，五蕴名色都源自于本识，本识之上不会再有法了。本识是三界中的第一因，不论彼时有佛、无佛出世，最究竟的道理就是如此，这是不会改变的定量；从无量生前一向就是如此了，所以把这个本识如来藏之法叫作古仙人道。