佛教正法中有一些咒语或手印是与佛、菩萨、护法神等的愿力相应，修行人因持咒、持印记而得到佛、菩萨的感应加持，一生便能见道而实证般若实相智慧的理体----实相心如来藏，就能证入中道的现观境界中。
像我们上次所举出的〈正觉总持咒〉：“五阴十八界，涅槃如来藏，般若道种智，函盖一切法。一切最胜故，与此相应故，二所现影故，三位差别故，四所显示故，如是次第现。具足解脱道，及佛菩提道，求正觉佛子，一切应受持。”这〈正觉总持咒〉已经含括 释迦世尊所宣演阿含、般若及唯识三转法轮的整个佛法架构及内涵，并且十方世界诸佛世尊固然因为所摄受众生根器、因缘不同，而有或也宣说声闻、缘觉、佛菩提三乘佛法；或合声闻、缘觉为解脱道，加上佛菩提道而宣说二乘佛法；乃至或有只说佛菩提一乘佛法，但是将声闻、缘觉二乘解脱道含摄在佛菩提佛乘中宣说。因此说〈正觉总持咒〉已经具足解脱道及佛菩提道，是一切佛法的总持，所以修行的佛门弟子如能配合修习无相念佛功夫所得的定力，每日以作意清净诵持〈正觉总持咒〉，所得功德威神不可思议，能令恶鬼远离；不论诵持时间长短、次数多寡，都有诵持此咒的大功德。如果每天将诵持此咒的功德，回向一切众生皆能早证三乘菩提，便可与累劫怨家解冤释结，更可同时利益往世亲属，广结善缘，自他皆得广大利益；进而若有因缘值遇真善知识，为他有次第地一一详细正确解说这〈正觉总持咒〉的内涵，然后也能依著次第实修，必定能得到诸佛菩萨的感应加持，随行者的心愿志趣，就能实证解脱道和佛菩提道。
但是咒语和手印还有一个意义，就是作为暗语、密语之用，用来区别不同的族类，也可以进一步用来召唤某一族类。像《梵网经》菩萨戒中十重戒的杀戒，说到不得咒杀，咒杀就是持咒语来杀人，然而于佛道真修实证的人，不会有杀害他人之心；有害他之心的人修证自然不高，当然都不是自己持咒直接取人性命，而是藉由所持咒语召唤驱使某一鬼神，或低阶的夜叉罗刹来杀人。例如律部经典中记载 世尊制戒，就严格禁止比丘行“毘陀罗法”，毘陀罗是一种起尸鬼的名称，行毘陀罗法的比丘，就是持毘陀罗咒，召唤起尸鬼毘陀罗来杀人。其实咒语并非仅有佛教中才有，像我国道教徒也有行咒术的，像《抱朴子内篇》卷4〈登涉篇〉就载有六甲秘咒，说这个咒可以让人在战斗中免于死亡，《太上紫微中天七元真经》也列有北斗七星咒、机星真人真君保命咒等。
而古时印度外道中的咒语，那当然也是所在多有，像《长阿含经》卷13中有一段经文说，佛告摩纳：【摩纳！如余沙门、婆罗门食他信施，行遮道法，邪命自活：或呪水火，或为鬼呪，或诵刹利呪，或诵鸟呪，或支节呪，或是安宅符呪，或火烧、鼠啮能为解呪，或诵别死生书，或读梦书，或相手面，或诵天文书，或诵一切音书。入我法者，无如是事。】(《长阿含经》卷13)这其中 世尊提到的诵持鬼咒、刹利咒、鸟咒等，也就是以咒语召唤驱使鬼神等各种族类来为外道办事。既然咒语和手印，本来就有总持或标记的意思，那么因为咒或手印所总持的法义及标记的族类正邪不同，持正咒、结善印，就容易感应召唤同样以此咒语为修学总持，或族类标记的真正护法菩萨、护法神；反之持恶咒、结邪印，则会感应外道的鬼神、罗刹、夜叉。
所以咒和手印都有善恶、邪正之别，如果是总持所修学正法的，就像〈正觉总持咒〉就是善咒，能为人治病或为防护己身免于受害的也是善咒。正如 佛陀在世的时候，弟子优波先那尊者被毒蛇所伤而死亡，因为他经过正法的修习，已断除对五阴十八界及地水火风空识六大我与我所的执着，也消除了自我存在而生起微细慢心的系缚，证得阿罗汉果，所以被毒蛇咬伤，临死的时候面色如常，没有显现一丝丝痛苦忧惧的变化，然而因为他被毒蛇所伤而死的缘故，世尊就为弟子们宣说了防治毒蛇的咒语，这是《杂阿含经》卷9中记载的事例。但是如果所诵的咒语是总持外道邪法，那就是恶咒，诅咒他人遭遇灾害，甚至结杀人的手印，当然也是恶咒、恶印。从前面提到的经典律典中记载显示，佛陀是不许弟子修习持诵恶咒、邪印作为自己资生活命的依凭，所以诃责这样的修行人是“行遮道法，邪命自活”，而严格禁止在佛法中有类似的情形，强调“入我法者，无如是事”；反之为了防护自身受到鬼道及畜生的恶害，或者为了正法道业的增进而诵持正咒、善印，则为 世尊所允许。
然而学佛人应该知道，现存大藏经中，有少数古人不查而收录的伪经，及不符合 释迦世尊三乘菩提正教的邪论，当然其中也会有部分外道恶咒和邪手印混杂在其中；这些咒语和手印，或者使用大多数人不会的梵文唱诵，或者仅是代表某种意象，而大多数人不明其意的手势，因此很难分辨其正邪与善恶。判断咒语的真假，与判断经典真伪的道理是一致的，因为经咒都是要帮助我们能够成就道业的增上，达到成佛利众及解脱的目标，如果违背此一宗旨，那就不是真实咒语，顶多是方便对治咒，甚至有许多是假咒、邪咒。而且持诵咒语，其实也是念佛的一种，因此持经咒者本身如理作意的忆持是关键所在，而不是在事相的口诵上面着眼；持咒的时候得要有咒语真义的一分作意在那边，才能够与佛菩萨的大愿及真实法义相应。
许多学佛人，未能建立正确看待持咒和结手印的观念，赋予咒语和手印过度神秘的面纱，尤其爱乐于持咒、结手印以求感应；其实正信的佛弟子应该明白，佛法是智慧法门，有感应不一定就能生起解脱智慧，遑论生起般若实相智慧；更何况所感应到的，究竟是不是真正的佛菩萨，还是不过是恶鬼、山精鬼魅，或天界中极为低阶的罗刹夜叉？因此若要持咒、结印，就得要持真正佛菩萨说的咒语，如〈大悲咒〉、〈楞严咒〉等，千万不能持念与鬼神相应的密咒，以免鬼神相应以后，产生负面作用却无法遣去，所谓“请神容易送神难”，精神病院中多数学佛人，半数以上都是属于这种人。